该国际协作团队借鉴物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型，开创性开发三维时空建模工具包Spateo，使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。
Spateo工具包提供多种算法选择，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、“形态计量向量场”以及用于交互式操作的可视化界面等独特优势。为验证其性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”，证实Spateo将显著提高人们对发育过程中器官形成的理解。
如果说以往的时空算法工具包更多的是辅助研究者观察数据，Spateo则具备系统性的统计能力与强大的分析能力。更具创意的是，Spateo的三维重建算法在拓展到两个甚《明发彩票计划》至多个完成重建的三维胚胎的配准工作时，能够自然地捕捉跨时间点的细胞迁移、凋亡和分裂分化事件。该方法在细胞层面完美解决了胚胎形态发生学的关键问题，为后续的形态计量算法奠定坚实基础。
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本报记者 维莱 【编辑:魏乔 】
