琶洲港澳客运口岸位于广州市海珠区阅江中路499号，位于广州有轨电车海珠环岛线“会展东”站和地铁8号线以及将陆续建成的11号线、28号线“琶洲站”附近，地处琶洲会展经济、总部经济和数字经济核心区域，旁边就是广交会展馆，是广州首座集跨境、城际、海岛功能的水上交通口岸综合体。
据介绍，琶洲港澳客运口岸试航期间，开通琶洲港往返香港中国客运码头(中港城《一分快3表格》)航线，航程两个半小时，每天1出1入。出境旅客进入联检楼大厅，在首层通过安检后，搭乘电梯前往二层出境大厅；在二层大厅，旅客可以在窗口购买船票，也可以办理自助取票和香港国际机场值机业务，办好值机业务后通过出境查验通道即可前往登船口。后续还将开通直达香港国际机场的“海天联运”往返航线，旅客仅花2小时，即可到达香港国际机场，无需再办理香港入关手续。
洲头嘴出入境边防检查站担负琶洲港澳客运口岸的出入境边防检查任务。该检查站站长何奋生介绍，目前出境大厅共有3条快捷通道和6条人工查验通道，入境大厅共有5条快捷通道和6条人工查验通道，充分满足出入境旅客通关需求。他表示，检查站还为参加广交会的入境旅客提供多语种服务。
